En junio de 1945, el Rector de la Universidad de Chile, Prof. Juvenal Hernández convocó a todos los profesores Titulares de la Escuela para dar por constituida la Facultad de Química y Farmacia, independizándola de la de Biología y Ciencias Médicas, la cual tomó más tarde el nombre de Facultad de Medicina, al haberse separado poco antes también la Facultad de Odontología.

En la sala de reuniones del Honorable Consejo Universitario, el Rector hizo una interesante exposición acerca del progreso que se había desarrollado en los últimos años en la Escuela de Química y Farmacia, lo que, unido al adelanto de las Ciencias Químicas habían hecho una necesidad, la creación de esta nueva Facultad.

El Decreto respectivo fijó su iniciación a partir del 1 de julio de 1945, nombrando como Decano al Prof. Juan lbáñez Gómez y como Secretario, al Prof. Herman Schmidt Hebbel. La verdadera importancia histórica de la creación de nuestra Facultad, relata el autor, fue su independencia docente, administrativa y financiera, dejando de ser un anexo de la Facultad de Medicina. Una vez creada la Facultad, ésta se abocó al estudio de un nuevo Plan de Enseñanza, ahora en 5 años, el cual entró en vigencia en marzo de 1947 

El primer Decano, Prof. Juan Ibáñez ejerció esta función por reelecciones sucesivas, durante un decenio (1945 – 1955)  y bajo su mandato se creó en 1954 la Escuela de Graduados. El Profesor César Leyton Garavagno ejerció el Decanato desde 1955 hasta su jubilación, a fines de 1961. Durante este gobierno, en 1956, creó el Instituto de Investigaciones y Ensayos Farmacológicos (IDIEF) destinado a un trabajo de extensión, de análisis de medicamentos y alimentos y que aún persiste.

El profesor César Leyton también estuvo a cargo de la creación del museo de Química y 

Farmacia, fundado en 1951, este se constituye como un espacio que resguarda la memoria y las trayectorias de esta área del conocimiento, así como también el quehacer universitario. Su 

Creado por César Leyton en 1951, este espacio resguarda la memoria y las trayectorias de esta área del conocimiento y del quehacer universitario, conservando microscopios, morteros, balanzas -entre otros valiosos materiales-, además de una completa biblioteca, que hoy se pretenden visibilizar y compartir con la comunidad universitaria y nacional a partir de un proceso de revitalización en curso. Este espacio permite el enlazamiento entre la ciencia química y farmacéutica con el patrimonio.

Decanos

Prof. Juan Ibáñez Gómez 1945 -1955

Prof. César Leyton Caravagno 1955 – 1961

Prof. Luis Ceruti Gardeazabal 1962 – 1968

Prof. Mario Caiozzi Marín 1968 – 1975

Prof. Carlos Mercado Schuler 1976 – 1981